Để vận hành hiệu quả một hệ thống lọc nước công nghiệp RO, người vận hành cần nắm rõ sơ đồ dây chuyền lọc nước công nghiệp. Đồng nghĩa với việc, hiểu rõ từng bước xử lý nước diễn ra như thế nào, vai trò của từng thiết bị ra sao, và các điểm kiểm soát chính cần theo dõi.